MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX4

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006675	CGC	2	6	40	45	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_006675	TGG	2	6	1188	1193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006675	TCATTT	2	12	1404	1415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_006675	ATT	2	6	1453	1458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006675	CTG	2	6	1539	1544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006675	GGC	2	6	1610	1615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006675	ATG	2	6	1667	1672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006675	CGAC	2	8	2276	2283	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006675	AGC	2	6	2335	2340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006675	GAT	2	6	2490	2495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006675	TTA	2	6	2507	2512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006675	GT	3	6	2539	2544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006675	ATAG	2	8	2666	2673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006675	CA	3	6	2681	2686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006675	GA	3	6	3758	3763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006675	GAA	2	6	3766	3771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006675	TTGA	2	8	3775	3782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006675	TGAT	2	8	3818	3825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006675	ATC	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006675	GCG	2	6	3925	3930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_006675	TTGA	2	8	3981	3988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006675	CTG	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006675	TCC	2	6	5183	5188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_006675	AACCAG	2	12	5189	5200	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006675	CG	3	6	5662	5667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006675	TAA	2	6	5724	5729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006675	ACG	2	6	5921	5926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006675	TGA	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006675	CTA	2	6	6048	6053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006675	GCG	2	6	6107	6112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006675	AGAC	2	8	6113	6120	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006675	A	7	7	6132	6138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006675	CT	3	6	6187	6192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006675	TG	4	8	6206	6213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006675	GAT	2	6	7115	7120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006675	ATCA	2	8	7168	7175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006675	ATCA	2	8	7210	7217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_006675	TTC	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006675	TC	3	6	7230	7235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006675	G	6	6	7247	7252	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006675	CGG	2	6	7281	7286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006675	AGGTC	2	10	7353	7362	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_006675	ACT	2	6	7962	7967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006675	GGAG	2	8	7987	7994	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006675	CAG	2	6	8020	8025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006675	TGC	2	6	8032	8037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006675	AGA	2	6	8842	8847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006675	TGGA	2	8	8928	8935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006675	CAG	2	6	9175	9180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006675	AGT	2	6	9193	9198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006675	GAT	2	6	9655	9660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006675	GAC	2	6	9688	9693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006675	TCAA	2	8	9710	9717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_006675	ATC	2	6	9757	9762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006675	AGC	2	6	9773	9778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006675	GCT	2	6	9900	9905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006675	CA	3	6	9910	9915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_006675	AG	3	6	9973	9978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006675	ACC	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_006675	CG	3	6	10082	10087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_006675	TA	3	6	10088	10093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006675	GAGAA	2	10	10592	10601	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006675	AACG	2	8	10693	10700	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_006675	TTGT	2	8	10745	10752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006675	CCA	2	6	11493	11498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_006675	TCCT	2	8	11571	11578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_006675	AG	5	10	11593	11602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006675	TCA	2	6	13062	13067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006675	CTG	2	6	13095	13100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006675	ACTCA	2	10	13106	13115	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_006675	GGC	2	6	13145	13150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006675	ACCGCA	2	12	13160	13171	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006675	ACC	2	6	13187	13192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.